A múzeum életében jelentős szerepet tölt be a múzeumpedagógia, gyűjteményünk tárgyainak, a történelem kézzel fogható oldalának megmutatása, szórakoztatva tanítása. A Balassa Bálint Múzeumban 2008 januárjától tartunk múzeumpedagógiai foglalkozásokat. Évente több ezer diák vesz részt ezeken az órákon, főleg Esztergomból és a régióbeli iskolákból. Ezt a fontos munkát segíti a 2012. október 30-án átadott és technikai eszközökkel felszerelt múzeumpedagógiai foglalkoztató helyiség, mely a TIOP 1.2.2-09/1 -2010-0010 „Múzeumok iskolabarát fejlesztése és oktatási-képzési szerepének infrastrukturális erősítése” című pályázaton elnyert 29 220 309 Ft támogatásból épülhetett meg. A pályázat kedvezményezettjei: először Esztergom Város Önkormányzata, majd a fenntartóváltást követően a Komárom-Esztergom Megyei Intézményfenntartó Központ.
A termet átadta: Dr. Völner Pál infrastruktúráért felelős államtitkár, köszöntőt mondott: Czunyiné Dr. Bertalan Judit Komárom-Esztergom Megyei kormánymegbízott és Hanesz József központvezető.
A TIOP pályázattal elnyert összeg lehetővé tette, hogy a múzeum egyik raktártermét átalakítsuk egy modern, kényelmes, minden korosztályhoz igazodó múzeumpedagógiai foglalkoztató teremmé. A terem óvodások, és nagyobb létszámú osztályok, de felnőttek fogadására is alkalmas, mobil, átalakítható bútorzata alkalmassá teszi kisebb konferenciák, egyéb színvonalas rendezvények megtartására.
A hatékony pedagógiai munkát több segédeszköz is segíti: interaktív tábla, a magyar Szent Korona másfélszeres nagyítású másolata, római kori fibula másolatok, a Várhegy makettje – Szent István, III. Béla, és Vitéz János korából. A makett épületei mozgathatóak, így a gyerekek maguk építhetik fel, milyen volt a Várhegy elrendezése különböző történeti korokban. Az elkészült római és reneszánsz kori jelmezeket felöltve jobban bele tudják élni magukat a tanulók az adott korszakba. Szintén ebből a pályázati forrásból sikerült megoldani, hogy a mozgássérültek fogadását lépcsőnjáró berendezés, és akadálymentesített mellékhelyiség is segíti az intézményben.