Antropológia:
Embertani adatok a Dunakanyar (Visegrád-Diós) késő római kori népességéhez – Anthropologiai Közlemények 42 (2001), 33-44.
Patológiás jelenségek vizsgálata Visegrád – Diós későrómai temetőjében – A Wosinsky Mór Múzeum Évkönyve XXIII (2001), 25-38.
A Dunakanyar (Tokod-Visegrád) római limesének embertani arculata a Kr.u. III-IV. században – II. Kárpát-medencei Biológiai Szimpózium, Előadások összefoglalói (2001), 303-307.
Embertani adatok Nyergesújfalu-Sánchegy későrómai kori népességéhez – Komárom-Esztergom Megyei Önkormányzat Múzeumainak Közleményei 9 (2002), 99-112.
Az Esztergom, Kossuth Lajos utcai késő római népesség sérülései és betegségei – A Békés Megyei Múzeumok Közleményei 24-25 (2003), 393-409.
E. Molnár – M. Merczi – A. Marcsik – A. Hegyi: „Butterfly” vertebrae in human osteoarchaeological series (Hungary) – Journal of Paleopathology 16/3 (2004), 117-124.
Frühkindliche Skelettfunde aus dem römischen Gutshof von Baláca – Balácai Közlemények IX (2005), 75-90.
A Kelet-Dunántúl népessége a késő római korban – Hadak Útján. Népességek és iparok a népvándorlás korában. A Népvándorláskor Fiatal kutatóinak XVI. konferenciáján Nagykovácsi, 2005. szeptember 26-28. elhangzott előadások. Nagykovácsi 2006, 37-52. (CD-ROM, www.koh.hu/hadak)
Traumás elváltozások Zülpich-Mühlenberg 9-11. századi temetőjében – Tatabányai Múzeum Tudományos Füzetek 8 (2006), 153-163.
Anthropologische Analyse der spätrömischen Skelettfunde aus der Villa von Babarc – in: Th.S. Burns, Zs. Visy und H. Bender: Die römische Siedlung von Babarc, Komitat Baranya (Ungarn). Die Ausgrabungen der Jahre 1978-1979 und 1996-1999. Rahden/Westf. 2007, 51-57.
Traumás elváltozások az Esztergom – Bánomi dűlői késő római temetőben – Folia Anthropologica 5 (2007), 79-91.
A Kelet-Dunántúlon élt késő római kori népesség újabb összehasonlító embertani vizsgálata – Anthropologiai Közlemények 48 (2007), 131-145. oldal)
Anthropologische Untersuchungen an einem Kinderskelett aus dem römischen Gräberfeld Budapest – Kaszásdűlő-Raktárrét (Grab 45–1881/82) APPENDIX zur Studie von András Márton – Folia Archaeologica LIII (2007), 175–178.
A castellumtemető (Esztergom – Bánomi dűlő) népességének embertani vizsgálata – in: H. Kelemen Márta: Solva. Esztergom későrómai temetői. Libelli Archaeologici Ser. Nov. No. III (2008), 401–478.
Sekundärbestattungen in dem frührömischen Hügel Nr. 1. von Kemenesszentpéter-Dombi Flur – Eine anthropologische Auswertung der Skelettfunde – THIASOS Festschrift für Erwin Pochmarski zum 65. Geburtstag. Veröffentlichungen des Instituts für Archäologie der Karl-Franzens-Universität Graz, Band 10 (2008), 639–647.
Újabb csontvázleletek a balácai római villagazdaság területéről – Neuere Skelettfunde aus dem römerzeitlichen Gutshof von Baláca – Balácai Közlemények X (2008), 188–199.
A bajóti késő középkori temetőrészlet embertani vizsgálata. – Komárom-Esztergom Megyei Múzeumok Közleményei 15 (2009), 23-37.
Verletzungen an spätrömischen Schädeln aus Nordost-Pannonien. – Waffen in Aktion. Akten der 16. Internationalen Roman Military Equipment Conference (ROMEC). Xantener Berichte 16 (2009), 165-182.
Tóth Gábor–Merczi Mónika: Sárvár (Vas megye) római kori temetője (Fontosabb embertani eredmények)” – Nyugat-Magyarországi Egyetem Savaria Egyetemi Központ Tudományos Közleményei XVII, Természettudományok 12 (2010), 165-176.
Valeria tartomány északi felének embertani képe a késő római korban (Tác-Margittelep és az északi határvidék összehasonlítása). – Alba Regia 39 (2010), 69-86.
Merczi Mónika–Tóth Gábor: Újabb adatok a Nyugat-Dunántúl késő római kori népességének embertanához. (Nagykanizsa: Inkey-kápolna és Palin lelőhelyek, 3-4. század) – Zalai Múzeum 19 (2010), 239-254.
Tamás Hajdu, Erzsébet Fóthi, Ivett Kőváry, Mónika Merczi, Attila Molnár, Gábor Maász, Péter Avar, Antónia Marcsik, László Márk: Bone tuberculosis in Roman Period Pannonia (Western Hungary)” – Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Vol. 107/8 (2012), 1048-1053.
Mónika Merczi, Antónia Marcsik, Zsolt Bernert, László Józsa, Krisztina Buczkó, Gábor Lassányi, Márta H. Kelemen, Péter Zádori, Csaba Vandulek, Gergely Bíró, Tamás Hajdu, Erika Molnár: Skeletal metastatic carcinomas from the Roman Period (1st-5thcenturyAD) in Hungary” – Pathobiology 81 (2014) 100-114.
Merczi Mónika-Tóth Gábor: Kelet- és Nyugat-Dunántúl népessége a római korban. in: FIRKÁK Fiatal Római Koros Kutatók III. Konferenciakötete (2014) 33-50.
Hajdu Tamás, Merczi Mónika, Marcsik Antónia, Bernert Zsolt, Józsa László, Buczkó Krisztina, H Kelemen Márta, Zádori Péter, Lelovics Zsuzsanna, Vandulek Csaba, Biró Gergely, Molnár Erika: Metasztatikus csontdaganatos esetek a római kori Pannóniából. [Skeletal metastases from the Roman Period of Pannonia – Anthropologiai Közlemények 55 (2014) 27-44.
Régészet:
Római kori gyűrűfibulák Komárom-Esztergom megyéből – Komárom-Esztergom Megyei Múzeumok Közleményei 7 (2000) 253-287.
H. Kelemen Márta–Merczi Mónika: Az esztergomi Várhegy 1934-38. évi ásatásának későkelta és római kori kerámiája – Komárom-Esztergom Megyei Múzeumok Közleményei 9 (2002) 25-72.
Kora római korongfibulák Komárom-Esztergom megyéből. – Specimina Nova Supplementum VIII (2009), 227-264.
Térdfibulák Komárom-Esztergom megyéből. – Komárom-Esztergom Megyei Múzeumok Közleményei 17 (2011), 7-79.
A Budaörs, Kamaraerdei dűlőben feltárt római vicus fibulái. – in: Ottományi Katalin: Római vicus Budaörsön 2012, 473-528.
Major Balázs, Mráv Zsolt, Merczi Mónika: Sárisáp, Quadriburg III – Kuny Domokos Múzeum Közleményei 19 (2013) 176-180.
Támlap nélküli egygombos, erősprofilú fibulák Északkelet-Pannoniából – Kuny Domokos Múzeum Közleményei 20 (2014) 7-31.